精液の検査をすると、精子の数が少なかったり、動きが悪かったり、形に異常がある場合があります。

これらはそれぞれ次のように呼ばれます：
●乏精子症（ぼうせいししょう）：精子の数が少ない
●精子無力症（せいしむりょくしょう）：精子の動きが弱い、またはほとんど動かない
●精子奇形症（せいしきけいしょう）：精子の形に異常が多い

これらの状態では、精子が卵子までたどり着けなかったり、卵管内でうまく受精できないことがあります。
そのため、妊娠しにくくなる原因のひとつになります。
これらの原因は特定されないものも多いですが、加齢や喫煙が影響を及ぼすことが知られています。
また、以下のような基礎疾患が原因となっている場合もあります。

精巣の上部や周囲に集まる細かな静脈の血液の流れが滞って、血管が怒張・うっ血している状態です。これにより陰嚢内の温度が上昇するため、造精機能に影響すると考えられています。
主に左側に起こりやすいことが分かっており、一般の男性の8～23％、男性不妊患者の21～39％と高率に認められます。

●停留精巣

精巣が正常な位置＝陰嚢内に位置しない状態のことをいいます。
精巣は胎児の頃にはおなかの中に存在し、妊娠30週くらいで陰嚢内に降りてきますが、途中で精巣が留まってしまう状態を停留精巣といいます。
陰嚢の中の温度は体温より低く、精巣の正常な発育と精子形成に適した環境となっていますが、停留精巣の場合、精巣がおなかの中やそけい部などに位置するため、体温に近い温度にさらされます。この高い温度が、精子の形成を妨げ、精子数が減ったり、精子の質が低下したりする可能性があります。

●内分泌障害

精子形成に関わるホルモンの分泌に異常がある状態です。生まれつきの疾患によるものや、外傷、感染症、腫瘍、放射線照射による影響、手術による影響などによって生じることもあります。

精子は、まず精巣（睾丸）で作られたあと、精巣上体 → 精管 → 尿道という道を通って体の外に出ます。
この通り道を「精路（せいろ）」といいます。
しかし、生まれつきの異常や、炎症、過去の手術などが原因で、この通り道がつまったり、傷ついたりすると、精子が外に出られなくなります。
このような状態を「精路通過障害（せいろつうかしょうがい）」と呼び、不妊の原因になることがあります。

また、逆行性射精（ぎゃっこうせいしゃせい）という状態もあります。
これは、射精のときに精子が正しい方向に出ずに、膀胱の中に逆流してしまう状態です。精子が体の外に出ないため、妊娠しにくくなります。

妊娠に関係する男性の問題として、勃起不全（ED）や性交のトラブル（性交障害）があります。
勃起不全（ED）とは、性的な興奮があっても、十分にペニスが硬くならなかったり、勃起が続かず性交ができない状態です。

性交障害にはいくつかのパターンがあります：
-マスターベーション（自慰行為）はできるが、性交渉（挿入行為）がうまくできない
-性交渉（挿入行為）はできるが、射精までいかない
これらの問題は、ストレス・疲労・飲酒・加齢などが原因となります。